加拿大工商联合总会的最高权力机构是会员大会。加拿大工商联合总会发起人自加拿大工商联合总会成立之时自动成为大会会员。

会员大会职权是:

(一)   制定和修改章程;

(二)   选举和罢免理事;

(三)   制定和修改《加拿大工商联合总会总会会费管理条例》;

(四)   审查加拿大工商联合总会财务报告、工作报告和下一年的财政预算,以及确定加拿大工商联合总会下一年的工作方针和政策

在加拿大工商联合总会登记的企业会员需书面指派一位代表出席会员大会,每位代表拥有投票权,任期为4年。会员大会必须由会员大会决议须到会会员半数以上表决通过方能生效。若此会员大会决议有任何一票否决则视为无效决议。